Di seguito una planimetria della Cripta, con le navate, i pilastri, gli ingressi e la relativa legenda, al fine di individuare, con facilità, oltre alle differenze esistenti tra struttura originaria e ricostruzione museale, la giusta ubicazione di ciascun affresco.
1 – San Nicola.
2 – San Giorgio nell’atto di trafiggere il drago.
3 – S. Gregorio Nazianzeno e S. Giovanni Teologo.
4 – Cristo Benedicente con ai suoi piedi la Maddalena e a destra S. Anastasio.
5 – S. Demetrio e S. Nicola.
6 – San Giovanni Teologo.
7 – San Lorenzo.
8 – Madonna con Bambino tra gli Arcangeli.
9 – Santo Stefano.
10 – San Michele Arcangelo.
11 – SS. Cosma e Damiano.
12 – S. Giovanni Battista.
13 – San Michele Arcangelo.
14 – San Giuliano.
15 – Madonna con Bambino e San Nicola.
16 – Madonna con Bambino.
17 – San Giorgio.
18 – Santo Ignoto.
A – Ingresso originario.
B – Accesso alla ricostruzione museale.
C, D, E – Pilastri assenti nella ricostruzione museale.
F – Pilastro riportato nella ricostruzione museale.